汎遺伝子発現制御
Technology Development and Modelling
汎遺伝子発現制御についての計測技術開発とモデル化
近年のトランスクリプトーム研究から、遺伝子発現は転写開始段階だけでなく、RNAの伸長、移送、分解の各段階において、精密に制御されていることが明らかになっている。当研究室では、最新のオミクス計測技術を基盤にこれらの制御要素の各段階において対応する新技術を開発、得られたデータを解析することでそのモデル化を行っている。 例えば、ゲノム塩基の置換がどのようにプロモーター活性に影響を及ぼすか、人為的に変異を導入したDNA配列を飽和規模で配列-活性相関を測定する実験系を開発し、機械学習等の手法を用いてデータ解析を行うことで予測モデルの構築を行っている。最終的には、遺伝子発現量を規定する要素としてのクロマチン構造、 mRNA分解速度等についてもモデルに取り込み、汎発現制御機構についてのモデル化を目指す。これにより臨床検体において見出されるゲノム多型・変異について、モデルの演繹から生物学的意義を推定することが可能になると考えている。